169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1481 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  100 
 
 		 322 aa  653    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  76.71 
 
 		 322 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  76.09 
 
 		 322 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  73.82 
 
 		 318 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  74.45 
 
 		 318 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  72.64 
 
 		 319 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  73.19 
 
 		 318 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  74.45 
 
 		 318 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  72.87 
 
 		 318 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  72.33 
 
 		 319 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  74.21 
 
 		 319 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  57.01 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  57.96 
 
 		 323 aa  352  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  57.96 
 
 		 323 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  57.64 
 
 		 323 aa  349  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2169  methyltransferase  56.66 
 
 		 323 aa  348  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  56.45 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  56.17 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  56.17 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  56.17 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  56.17 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  56.17 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  56.17 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  56.17 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  56.17 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  58.73 
 
 		 323 aa  345  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  58.73 
 
 		 323 aa  345  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  58.73 
 
 		 323 aa  345  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  58.73 
 
 		 323 aa  345  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  55.86 
 
 		 323 aa  344  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  58.41 
 
 		 323 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.710945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  57.01 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  52.98 
 
 		 323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  52.65 
 
 		 323 aa  341  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  55.9 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  55.48 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  55.73 
 
 		 330 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2266  methyltransferase  54.49 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2094  methyltransferase  54.18 
 
 		 327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  52.35 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  52.5 
 
 		 323 aa  338  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  55.87 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  53.42 
 
 		 328 aa  338  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  55.48 
 
 		 324 aa  338  7e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  53.73 
 
 		 330 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  53.37 
 
 		 330 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  54.15 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  53.11 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  53.11 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  52.02 
 
 		 321 aa  332  4e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  53.11 
 
 		 330 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  53.11 
 
 		 330 aa  332  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  51.1 
 
 		 332 aa  332  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  52.76 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  53.11 
 
 		 330 aa  331  8e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  52.01 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2787  putative methyltransferase  54.6 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1810  methyltransferase  55.42 
 
 		 328 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  52.04 
 
 		 323 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  52.45 
 
 		 331 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  52.45 
 
 		 331 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  52.45 
 
 		 331 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  53.73 
 
 		 330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  52.45 
 
 		 331 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  51.72 
 
 		 322 aa  328  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  52.56 
 
 		 332 aa  324  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  55.63 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  51.84 
 
 		 330 aa  322  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1948  hypothetical protein  52.48 
 
 		 350 aa  322  5e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2241  methyltransferase, putative  48.73 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0291  putative methyltransferase  47.69 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2394  methyltransferase  52.2 
 
 		 342 aa  296  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  47.34 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  43.09 
 
 		 289 aa  232  7.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4909  methyltransferase, putative  40.64 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.628924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  43.64 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  39.58 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  40.7 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  40.91 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  41.88 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  37.77 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  37.41 
 
 		 291 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  36.69 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  35.4 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  31.7 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  30.8 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  32.07 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  29.92 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  31.52 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  30.5 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  32.78 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  30.73 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>