More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3179 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  45.85 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  45.67 
 
 
251 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0029  methyltransferase type 11  44.86 
 
 
237 aa  211  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  45.67 
 
 
251 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  45.67 
 
 
251 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  45.67 
 
 
251 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  45.67 
 
 
251 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  44.71 
 
 
251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  45.67 
 
 
251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1863  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  54.55 
 
 
89 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1864  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  39.31 
 
 
153 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.804482  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  25.56 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  23.89 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  25.56 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  26.77 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  26.18 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  26.11 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  23.11 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  23.11 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  25.87 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  22.64 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  22.64 
 
 
283 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  22.64 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  22.64 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  22.64 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  20.57 
 
 
293 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
221 aa  62  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  27.84 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  22.97 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  22.71 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  21.83 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.12 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  24.73 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  21.51 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  24.53 
 
 
264 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.09 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  22.91 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  22.42 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  27.59 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  24.74 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  20.24 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  25.24 
 
 
316 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  24.18 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
283 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.07 
 
 
351 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
209 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
634 aa  55.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  23.24 
 
 
362 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  24.7 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  19.46 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.44 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  22.49 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  26.37 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  24.15 
 
 
300 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  23.27 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  25.32 
 
 
288 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  23.72 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  25.14 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  23.44 
 
 
266 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  28.81 
 
 
207 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  30.19 
 
 
215 aa  52  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  27.5 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  26.32 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00196  biotin synthesis protein  25 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  22.48 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  24.39 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  30.77 
 
 
392 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6573  Methyltransferase type 11  30 
 
 
610 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.03 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  29.85 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.67 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  24.38 
 
 
250 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.78 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  24 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  24 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.59 
 
 
273 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
314 aa  49.3  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  23.84 
 
 
252 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.21 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>