271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1936 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  100 
 
 
199 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  34.83 
 
 
218 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  40.46 
 
 
197 aa  104  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  35.59 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  38.71 
 
 
207 aa  97.8  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  42.07 
 
 
227 aa  94.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  38.07 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  39.66 
 
 
204 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
218 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  37.58 
 
 
243 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  32.5 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  36.88 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  39.69 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  41.88 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
253 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  29.01 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  30.3 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  33.89 
 
 
223 aa  77.8  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  32.9 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  34.02 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  33.08 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.78 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  26.86 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  34.01 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  34.32 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  35.92 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  35.46 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  26.09 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  32.34 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  38.52 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  35.04 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  27.64 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.28 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  24.86 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  34.44 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  25.25 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  28.14 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  35.77 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  31.14 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  29.3 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  38.33 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  35.77 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  35.77 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  35.77 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  28.66 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  33.96 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30.53 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  31.65 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 
167 aa  61.6  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  23.84 
 
 
277 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 
217 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  24.26 
 
 
199 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  38.71 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
290 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  29.29 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  31.35 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  31.76 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  23.23 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  23.87 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
280 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  27.54 
 
 
194 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  27.35 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  30.06 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  22.58 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  22.58 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  25.33 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  31.19 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  33.11 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  30.64 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>