253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0780 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  100 
 
 
221 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  80.72 
 
 
167 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  49.75 
 
 
212 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  46.5 
 
 
209 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  45.77 
 
 
201 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  46.5 
 
 
207 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  39.71 
 
 
201 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 
204 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  43.43 
 
 
217 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  42.13 
 
 
208 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  41.92 
 
 
211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  42.93 
 
 
204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  40.4 
 
 
201 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  40.7 
 
 
198 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  41.58 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  42.57 
 
 
213 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  37 
 
 
200 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  36.55 
 
 
198 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  34.67 
 
 
197 aa  141  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
199 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  37.13 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  36.04 
 
 
194 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  34.15 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  34.67 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  34.67 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  35.18 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  35.53 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  33.67 
 
 
200 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  33.67 
 
 
200 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 
200 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
200 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  29.5 
 
 
205 aa  104  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  40.31 
 
 
149 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
207 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  32.29 
 
 
207 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  31.34 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  31.86 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  29.94 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.35 
 
 
190 aa  84.7  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  30.59 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.94 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  34.85 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  31.34 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  29.48 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  28.24 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  28.76 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  31.36 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  28.76 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 
190 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  28.15 
 
 
190 aa  61.6  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  31.3 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  30.56 
 
 
663 aa  58.9  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 
198 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  26.97 
 
 
177 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  26.62 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  25.43 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  24.05 
 
 
277 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28.35 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  28.35 
 
 
236 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  28.35 
 
 
236 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  28.35 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
202 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  26.05 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  28.35 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  27.51 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  29.77 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  24.82 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.27 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  27.32 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  27.51 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  22.29 
 
 
250 aa  52.4  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  29.86 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  28.21 
 
 
205 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  28.21 
 
 
205 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
205 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  27.23 
 
 
236 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
290 aa  51.6  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  30.97 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>