215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3405 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  54.36 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  54.64 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  50.78 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  51.55 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  49.23 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  49.22 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  46.23 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  49.22 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  44.39 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 200 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  39 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  36.08 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  36.6 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  50.4 
 
 		 149 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  35.86 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  36.22 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  37.06 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  36.22 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  35.35 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  36.95 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  34.52 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  36.04 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  32.4 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  33.67 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  35.47 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  32.32 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  36.02 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  33.14 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  35.68 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  40 
 
 		 290 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  31.32 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  29.59 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  29.11 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  36.03 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  28.49 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  27.11 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  35.38 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  32.12 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  32.45 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  34.51 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  31.91 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  32.24 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  32.62 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  32.62 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  32.62 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  32.62 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  32.62 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  32.62 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  28.57 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  35.07 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  33.83 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  28.82 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  29.84 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  33.08 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  24.61 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  31.65 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  31.33 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  33.57 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  31.06 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  28.92 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>