107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2302 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  70.53 
 
 
207 aa  279  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  58.74 
 
 
217 aa  260  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  39.2 
 
 
194 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  36.23 
 
 
201 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  35.92 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  38.69 
 
 
194 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  35.64 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
204 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  35.64 
 
 
200 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  33.17 
 
 
199 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  35.44 
 
 
235 aa  125  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  31.82 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  35.18 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  33 
 
 
200 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  34.65 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  35.18 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  32.16 
 
 
200 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  32.16 
 
 
200 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  32.68 
 
 
221 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  31.92 
 
 
208 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  32.84 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
204 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
211 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  30.48 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  28.71 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  28.22 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  26.87 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  35.11 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  27.36 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  25 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  25 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  27.23 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  26.11 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  25.99 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  27.61 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  29.47 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.41 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  26.25 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  30.77 
 
 
410 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  23.5 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.77 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  35.44 
 
 
243 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  23.75 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  26.49 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  31.39 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  26.34 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 
243 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  25.95 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  25.4 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  29.68 
 
 
168 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  25.4 
 
 
236 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  25.41 
 
 
221 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 
204 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  25.4 
 
 
236 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  26.7 
 
 
194 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  25.4 
 
 
236 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
210 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  25.52 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  25.4 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  25.26 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  26.52 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  26.88 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  24.16 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  29.27 
 
 
208 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  22.75 
 
 
276 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  27.75 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  25.35 
 
 
544 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  30.17 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  27.08 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  24.04 
 
 
266 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 
277 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>