219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4789 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  48.37 
 
 		 227 aa  160  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  46.6 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  46.88 
 
 		 196 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  44.88 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  44.17 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  42.78 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  42.23 
 
 		 544 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  43.72 
 
 		 218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  39.71 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  40.61 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  38.54 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  43.3 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  38.69 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  47.92 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  37.79 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  42.5 
 
 		 410 aa  101  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  37.69 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  35.96 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  37.57 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  36.9 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  40.97 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  36.46 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  38.97 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  41.13 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  37.86 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  46.62 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  38.76 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  37.93 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  38.81 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  38.81 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  33.19 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  41.28 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  39.86 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  43.31 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.19 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  26.76 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  27.82 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  32.64 
 
 		 396 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  33.81 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  38.95 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.59 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  39.6 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5314  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  30.81 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  35.11 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  32.2 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  28.06 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.12 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 280 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  31.21 
 
 		 177 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  35.63 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  34.65 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  35.63 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  35.63 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  35.63 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  28.12 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  35.63 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  35.63 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  35.63 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  31.36 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  46.15 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3813  methyltransferase type 12  38.61 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  29.85 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  23.84 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.85 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  27.41 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3689  Methyltransferase type 12  42.11 
 
 		 270 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00200869  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  54.76 
 
 		 358 aa  48.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>