228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0435 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  100 
 
 
243 aa  473  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  39.9 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  44.76 
 
 
197 aa  108  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  44.22 
 
 
200 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  39.22 
 
 
196 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  47.14 
 
 
204 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  41.01 
 
 
207 aa  99  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  38.73 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  45.71 
 
 
218 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
208 aa  95.1  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  38.19 
 
 
208 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  40.29 
 
 
199 aa  92.8  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  36.09 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  39.3 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  36.82 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  34.74 
 
 
217 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  39.71 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
199 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  38.41 
 
 
198 aa  85.9  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  39.43 
 
 
200 aa  85.5  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  35 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  28.37 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  28.99 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  35.12 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  27.54 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  27.54 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  40.29 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  40.29 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  40.29 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  36.6 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
544 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  36.14 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  36.69 
 
 
215 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  31.98 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  37.41 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  37.68 
 
 
221 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  36.94 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  38.97 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  34.56 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  38.57 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  35 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  28.5 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  37.41 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  36.76 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  38.03 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  36.88 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  37.3 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.87 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  38.13 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  35.92 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  33.56 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 
167 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  35.68 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  29.95 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
149 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  26.8 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.39 
 
 
189 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  29.57 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
199 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  34.48 
 
 
177 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  30.72 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  29.8 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
207 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  29.58 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  31.11 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  35.44 
 
 
207 aa  58.9  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  32.61 
 
 
217 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  28.97 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  25.59 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  31.17 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  30.51 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  28.17 
 
 
190 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  29.53 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  34.62 
 
 
183 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  33.33 
 
 
396 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>