More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0025 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  44.17 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  37.8 
 
 
183 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  35.4 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  38.73 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  35.59 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  36.9 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  39.1 
 
 
174 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  39.74 
 
 
174 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  35.67 
 
 
181 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  38.46 
 
 
174 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  35.67 
 
 
181 aa  94.4  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  35.67 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  35.67 
 
 
181 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  37.27 
 
 
175 aa  91.3  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  32.09 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
195 aa  89  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  36.9 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  38.46 
 
 
168 aa  88.2  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  32.63 
 
 
194 aa  87.8  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  35.8 
 
 
199 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  35.85 
 
 
177 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  34.57 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  38.93 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  36.09 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  36.47 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  40.74 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  35.2 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  35.2 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  35.8 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  35.96 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  35.96 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  36.09 
 
 
191 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  35 
 
 
212 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.26 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  39.74 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  34.64 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  31.95 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  38.56 
 
 
177 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  33.55 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  37.93 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  34.42 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  37.11 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  32.84 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  38.56 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  34.09 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  33.52 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  34.3 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  35.29 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
200 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  36.48 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  39.24 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  32.74 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  36.48 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  36.48 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  32.35 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  34.59 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  30.87 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  27.13 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  27.13 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  34.97 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  27.52 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  30.87 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  30.87 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  30.87 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  28.08 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
202 aa  72  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  30.49 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30.89 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  28.57 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  34.12 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  30.77 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  35.51 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  30.41 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  29.9 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  30.2 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.53 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  34.46 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  29.53 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  31.58 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  29.53 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  29.53 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  26.06 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13353  methyltransferase  33.33 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.356592  normal  0.242787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>