222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6101 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  100 
 
 
320 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1319  methyltransferase type 12  98.75 
 
 
320 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6510  methyltransferase type 12  98.75 
 
 
320 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  78.44 
 
 
320 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5945  methyltransferase type 12  45.79 
 
 
677 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3804  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.99 
 
 
456 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119292  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.69 
 
 
445 aa  59.3  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  24.28 
 
 
2490 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  27.54 
 
 
1914 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.61 
 
 
420 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  24.34 
 
 
394 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5273  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.22 
 
 
418 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5365  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.22 
 
 
428 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552994  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  25.76 
 
 
423 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.89 
 
 
428 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1147  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.64 
 
 
442 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.18 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.78 
 
 
394 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  34.19 
 
 
1140 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0720096  normal  0.188853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  25.22 
 
 
394 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  29.35 
 
 
224 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  28.92 
 
 
4483 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.57 
 
 
421 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  23.37 
 
 
273 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  27.33 
 
 
2997 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0650  hypothetical protein  27.71 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.26 
 
 
482 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  24.61 
 
 
208 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.12 
 
 
419 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.17 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
271 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3969  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.22 
 
 
298 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00511048  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  33.11 
 
 
261 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.66 
 
 
394 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.52 
 
 
420 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4563  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.2 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25 
 
 
213 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0580  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  21.59 
 
 
403 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  24 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  31.53 
 
 
2012 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1199  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
286 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.91 
 
 
434 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0777  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.68 
 
 
442 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0790  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.52 
 
 
398 aa  49.7  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000257674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.28 
 
 
420 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1926  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.09 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1480  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.65 
 
 
387 aa  49.3  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3810  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.28 
 
 
366 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.22407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.62 
 
 
7541 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.54 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2396  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.15 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  23.78 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.66 
 
 
258 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2969  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.15 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  28.32 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.91 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0329  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.93 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  28.93 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1175  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.18 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  39.08 
 
 
2082 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1720  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.48 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1527  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.53 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  26.32 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0963  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.86 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1283  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.52 
 
 
440 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204658  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0428  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.78 
 
 
440 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.69 
 
 
419 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.48 
 
 
283 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.69 
 
 
419 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1055  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.51 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.910912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1388  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.82 
 
 
407 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.420857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.19 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
234 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  31.05 
 
 
223 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5037  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.63 
 
 
422 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
273 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5532  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.7 
 
 
440 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5276  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.78 
 
 
431 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00305664  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1253  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.44 
 
 
420 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.087118  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  29.2 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2838  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.91 
 
 
409 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1647  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.48 
 
 
436 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0262651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.54 
 
 
494 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  29.2 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2687  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  28.68 
 
 
207 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38159  predicted protein  22.83 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  29.69 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  26.13 
 
 
253 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  26.13 
 
 
253 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>