More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 386 aa  793    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.61 
 
 		 200 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  36.11 
 
 		 211 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 208 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  34.38 
 
 		 191 aa  127  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.5 
 
 		 203 aa  122  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 223 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  36.32 
 
 		 191 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  34.41 
 
 		 191 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  34.04 
 
 		 192 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  31.02 
 
 		 196 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  35.61 
 
 		 196 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  34.62 
 
 		 193 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  37.12 
 
 		 196 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  33.87 
 
 		 189 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  35.33 
 
 		 192 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  32.45 
 
 		 192 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  33.51 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  32.45 
 
 		 197 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  32.45 
 
 		 197 aa  98.6  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  27.51 
 
 		 205 aa  98.2  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  30.85 
 
 		 192 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 200 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  31.77 
 
 		 217 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 200 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  31.11 
 
 		 196 aa  90.1  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 209 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.3 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 201 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.43 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.03 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 199 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7117  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.829004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  28.93 
 
 		 181 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.49 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.27 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.19 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  29.53 
 
 		 180 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.74 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  31.78 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  31.78 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  26 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  26 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  26 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.03 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.36 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.36 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.36 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  34.31 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  26.95 
 
 		 267 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.83 
 
 		 223 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  26.58 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  28.24 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  22.02 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.64 
 
 		 165 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.36 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.79 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.04 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.51 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.26 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.75 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  29.82 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.85 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  25.63 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  27.81 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1285  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>