201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2217 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  65.45 
 
 		 197 aa  264  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  65.1 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  61.26 
 
 		 192 aa  254  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  60.73 
 
 		 192 aa  250  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  48.92 
 
 		 189 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  49.2 
 
 		 191 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  50.27 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  41.58 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  44.15 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  42.93 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  39.27 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  38.02 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  33.33 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.04 
 
 		 386 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  35.9 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  31.14 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  30.43 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.75 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.56 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.1 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.04 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  33.33 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.2 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.97 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  31.65 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.89 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.67 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.65 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.01 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  22.63 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  28.86 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.59 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.03 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.19 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.38 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  29.09 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.61 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  29.56 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  24.44 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  26.83 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  31.06 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.88 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  26.11 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  24.72 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.87 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  22.83 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  22.95 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  22.83 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.32 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  22.95 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  22.95 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.24 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  22.95 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  22.95 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  31.45 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  25.56 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  23.46 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.16 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.93 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  32.03 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  32.03 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  26.32 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.95 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  27.65 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  28.4 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  20.26 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.11 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  25.45 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  30.86 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.97 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.24 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  25.42 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  22.78 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25.34 
 
 		 166 aa  51.6  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.49 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.38 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  30.46 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  22.4 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  26.56 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  28.48 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  27.45 
 
 		 321 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.21 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.75 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.33 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  24.16 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.57 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.09 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  25 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.4 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  24.83 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.49 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  26.49 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  26.8 
 
 		 321 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  23.33 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  30.36 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  28.66 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  28.66 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  25.67 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.67 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>