More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2105 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  68.6 
 
 		 172 aa  254  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  65.7 
 
 		 172 aa  245  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  63.95 
 
 		 195 aa  244  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  66.28 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  54.34 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  52.6 
 
 		 173 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  57.06 
 
 		 170 aa  194  7e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  53.7 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  51.16 
 
 		 176 aa  187  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  51.45 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  45.51 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  41.14 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  38.55 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  35.84 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  40 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35.96 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  38.41 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  35.8 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  35.8 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  35.23 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  35.23 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  32.91 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  36.94 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.77 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.16 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  35.71 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  33.33 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  36.54 
 
 		 187 aa  98.2  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.94 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.96 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  32.72 
 
 		 278 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.96 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  32.75 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  32.75 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36.2 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  34.62 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.24 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  33.12 
 
 		 170 aa  91.3  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  30.99 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  31.43 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  37.91 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  33.33 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.21 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.55 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  35.67 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.11 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.17 
 
 		 186 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  33.33 
 
 		 167 aa  84.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.89 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.18 
 
 		 194 aa  84  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30.73 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  30.2 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.12 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.16 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.06 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.3 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.8 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.63 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  32.53 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.9 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  30.06 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  32.39 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.87 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.9 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.95 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.33 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  31.17 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  34.23 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.94 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.14 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.11 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.32 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  32.37 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.33 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.92 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  30.38 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.72 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.17 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.48 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  27.65 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.82 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.54 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  29.32 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25.83 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  31.61 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.72 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  31.29 
 
 		 321 aa  72  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  27.32 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.74 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  31.29 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  27.93 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.71 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  28.41 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.77 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.34 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  26.62 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  29.32 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  27.59 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.89 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>