More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1997 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  61.36 
 
 
195 aa  236  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  66.28 
 
 
176 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  59.88 
 
 
172 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  59.88 
 
 
172 aa  208  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  55.09 
 
 
170 aa  193  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  48.28 
 
 
176 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  52.91 
 
 
173 aa  185  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  57.49 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  52.91 
 
 
175 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  47.67 
 
 
176 aa  175  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  43.6 
 
 
173 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  41.18 
 
 
184 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  43.51 
 
 
169 aa  124  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35.84 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  34.3 
 
 
172 aa  114  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  37.57 
 
 
171 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  37.91 
 
 
163 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  35.8 
 
 
174 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  35.48 
 
 
165 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  33.92 
 
 
173 aa  100  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  35.76 
 
 
178 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  33.75 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  32.2 
 
 
169 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  32.75 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  34.18 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.33 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  34.5 
 
 
170 aa  95.1  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  32.16 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
171 aa  94  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
171 aa  94  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  33.9 
 
 
174 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30.13 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  36 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.48 
 
 
173 aa  92  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.32 
 
 
173 aa  92  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  35.29 
 
 
187 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.71 
 
 
170 aa  90.9  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.47 
 
 
176 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.58 
 
 
278 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.77 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.53 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.74 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.3 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.74 
 
 
166 aa  85.1  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  30.2 
 
 
168 aa  84.7  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.25 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  27.01 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  32.34 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  27.98 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  33.52 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.8 
 
 
176 aa  82  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.16 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  29.71 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.21 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.21 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.18 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.73 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.94 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30.51 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.93 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  34.9 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.27 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.48 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.97 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  30.67 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.88 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.88 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.88 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.12 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.11 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.53 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.03 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  30.57 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.81 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  28.12 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.71 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.62 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.3 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.48 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.38 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.97 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.33 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  26.19 
 
 
262 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.01 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.41 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  29.34 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.68 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.45 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  31.71 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.01 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.49 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  28.83 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.81 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  26.92 
 
 
248 aa  64.3  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  28.57 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  25 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.4 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>