262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0660 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  100 
 
 
184 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  41.14 
 
 
176 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  41.82 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  42.35 
 
 
172 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  40.61 
 
 
172 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  42.35 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  42.44 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  41.18 
 
 
182 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  42.95 
 
 
176 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  46.71 
 
 
173 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  41.25 
 
 
170 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  38.31 
 
 
170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  36.09 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  34.32 
 
 
172 aa  97.8  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  34.62 
 
 
178 aa  91.7  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  34.76 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.75 
 
 
163 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  32.52 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  34.39 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.01 
 
 
278 aa  81.3  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.43 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.4 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.2 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  34.36 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.69 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.3 
 
 
169 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.78 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.16 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  31.37 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  34.13 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.38 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.25 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.85 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.74 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  29.3 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.63 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  33.33 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.69 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.63 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.16 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.05 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  25.33 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.13 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.59 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.87 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  31.55 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.41 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  26.55 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  30.22 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.51 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.12 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.32 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.07 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.12 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.4 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.74 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.51 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  29.11 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  27.7 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.68 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  28.22 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  24.86 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  28.48 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.67 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.11 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  33.09 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.55 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  30.63 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.12 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  28.57 
 
 
279 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  30.13 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  25 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  24.83 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  24.88 
 
 
248 aa  62  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  25.29 
 
 
168 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  24.69 
 
 
197 aa  62  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  27.04 
 
 
274 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  27.45 
 
 
187 aa  61.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  26.67 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  27.5 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.39 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  26.62 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  23.73 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  23.95 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  30.53 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  25.62 
 
 
330 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.54 
 
 
274 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.82 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  30.72 
 
 
174 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  22.11 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.6 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.71 
 
 
171 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  28.93 
 
 
272 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  24.85 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.96 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  28.21 
 
 
867 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  23.72 
 
 
215 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>