More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2373 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  100 
 
 		 172 aa  353  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  90.7 
 
 		 172 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  65.7 
 
 		 176 aa  245  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  61.63 
 
 		 195 aa  225  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  59.88 
 
 		 182 aa  208  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  50.58 
 
 		 176 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  53.29 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  51.76 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  54.12 
 
 		 170 aa  184  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  44.77 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  51.16 
 
 		 175 aa  167  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  46.11 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  37.21 
 
 		 172 aa  127  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  40.61 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  35.09 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35.12 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  36.6 
 
 		 163 aa  97.4  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  32.18 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  37.5 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  34.13 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  32.18 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30.46 
 
 		 169 aa  94.4  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  30.11 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.54 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  32.18 
 
 		 169 aa  92  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  35.03 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  36.84 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  31.61 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  30.46 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  30.46 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  30.46 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.76 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.65 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  31.25 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  32.24 
 
 		 278 aa  87.8  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.98 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.41 
 
 		 173 aa  87.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.03 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.73 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.84 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  35.06 
 
 		 187 aa  84.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  31.55 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32.03 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.76 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.63 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  33.53 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.16 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  35.29 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  31.14 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.19 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  28.98 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.82 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.7 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  30.77 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.54 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.66 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.4 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25.97 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30.77 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.55 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  32.89 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.65 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.97 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.49 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.57 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.73 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  28.14 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.49 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.05 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.32 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  35.59 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.65 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.63 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.98 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  26.85 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.98 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  29.56 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.45 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.76 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  30.17 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.39 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.3 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.55 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.85 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.81 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  27.59 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.67 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.93 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.67 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  26.82 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.21 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.07 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.49 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.07 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  30.64 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  24.85 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  25.28 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  24.4 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  30.26 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  24.44 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>