More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2525 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  100 
 
 		 167 aa  338  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  73.05 
 
 		 167 aa  257  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  58.08 
 
 		 173 aa  185  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  54.94 
 
 		 170 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  52.73 
 
 		 180 aa  183  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  55.35 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  56.63 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  53.29 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  51.52 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  55.49 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.76 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  41.06 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  38.04 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  36.77 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  40 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  39.38 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  36 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  38.46 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  34.21 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  42.04 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  38.51 
 
 		 176 aa  103  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  40.65 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  40.65 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.53 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  36.65 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.85 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  41.18 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  37.11 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  34.62 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.53 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  35.76 
 
 		 170 aa  97.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  37.97 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  34.16 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  39.35 
 
 		 197 aa  94  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  33.55 
 
 		 173 aa  94  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  40.91 
 
 		 274 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  34.21 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  33.55 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  33.55 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  35.16 
 
 		 186 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.22 
 
 		 196 aa  92  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  34.57 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  32.88 
 
 		 167 aa  91.7  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  35.48 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.91 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  36.94 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  31.03 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  35.48 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.53 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.18 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  30.22 
 
 		 196 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  32.6 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.82 
 
 		 176 aa  87.8  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  32.26 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.42 
 
 		 184 aa  87.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  33.13 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  33.77 
 
 		 201 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  35.98 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  33.99 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  31.03 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  37.29 
 
 		 257 aa  85.5  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  31.37 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.86 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.63 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.18 
 
 		 212 aa  85.1  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  40.51 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  33.51 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  33.53 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  34.52 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  35.81 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  33.33 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  30.85 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  34 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  35.19 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  29.3 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  29.77 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.47 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  34.44 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  29.3 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  29.3 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  33.93 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  30.29 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  34.67 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  31.01 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  37.11 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  32.99 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  29.72 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  34.13 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  28.84 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  28.84 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  28.84 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  28.84 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.95 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  34.01 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.18 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.77 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  28.84 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.83 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>