More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1974 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  38.12 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  36.07 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.35 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.57 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.35 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.83 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.8 
 
 		 168 aa  84.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.94 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  31.34 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.18 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.02 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.47 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  30.65 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.38 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  27.18 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  29.47 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.69 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.37 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.1 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.32 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.18 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  27.66 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.7 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  34.09 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.11 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  26.2 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.32 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  26.4 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.04 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30.18 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  30.06 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  33.14 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  27.32 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  35.07 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  33.33 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  32.26 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.12 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  24.29 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  27.47 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.42 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.55 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.49 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  28.64 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.11 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  25.52 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  23.86 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  26 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.09 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.2 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  25.71 
 
 		 348 aa  64.3  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  25.53 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  27.75 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.39 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  27.65 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  24.86 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  28.14 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.04 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  28.42 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  28.42 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.83 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  23.35 
 
 		 431 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.8 
 
 		 215 aa  62  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.78 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  24.87 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.3 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5999  nitroreductase  24.51 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.28 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  27.03 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  26.44 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.92 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  28.15 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  26.42 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  24.73 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  28.02 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  26.5 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.52 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  22.4 
 
 		 423 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.63 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  25 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  25.14 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.46 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  26.23 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.85 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.94 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.59 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.25 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.13 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.07 
 
 		 345 aa  58.2  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  25.24 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  25.24 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  25.24 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  26.04 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  24.76 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  25.24 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.04 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  24.76 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  25.27 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>