More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1720 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  100 
 
 
196 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  57.22 
 
 
187 aa  245  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  48.19 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  41.49 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  43.71 
 
 
185 aa  162  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  42.01 
 
 
191 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  42.01 
 
 
214 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  36.17 
 
 
202 aa  139  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  39.04 
 
 
185 aa  137  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  33.33 
 
 
188 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.68 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  37.65 
 
 
188 aa  123  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  40.66 
 
 
189 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  35.67 
 
 
189 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  33.14 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  32.47 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  35.09 
 
 
188 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  32.4 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  34.13 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  35.67 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  35.09 
 
 
188 aa  108  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  31.87 
 
 
275 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  31.79 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  28.9 
 
 
192 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  29.74 
 
 
274 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.79 
 
 
165 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  30.18 
 
 
174 aa  91.7  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  33.85 
 
 
191 aa  91.7  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  33.33 
 
 
174 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.22 
 
 
167 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.98 
 
 
190 aa  88.2  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.14 
 
 
186 aa  88.2  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.57 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.45 
 
 
287 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.33 
 
 
170 aa  86.3  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.05 
 
 
174 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.17 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.57 
 
 
166 aa  85.1  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.43 
 
 
186 aa  85.1  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  33.14 
 
 
263 aa  84.7  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.06 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.43 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  33.52 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.57 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.5 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  31.07 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.48 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.12 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.37 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.33 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  32 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.33 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.67 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  35.09 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  29.95 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  29.26 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  28.57 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  26.7 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.65 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  27.96 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.17 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.32 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.61 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  33.14 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.33 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  25.7 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.86 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  28.8 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.82 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.62 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.01 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.47 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.91 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  27.88 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  27.81 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.24 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  31.64 
 
 
284 aa  74.7  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  26.29 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.29 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  27.33 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.56 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  28.25 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.39 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.12 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.17 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  28.49 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  28.95 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  26.09 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  26.04 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  27.44 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.77 
 
 
236 aa  72  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  27.89 
 
 
274 aa  72  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.74 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.61 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  28.32 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  28.82 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.88 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.49 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>