More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1356 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  100 
 
 
194 aa  393  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  44.13 
 
 
188 aa  174  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  41.49 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  45.14 
 
 
202 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  38.92 
 
 
187 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  39.57 
 
 
185 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  36.53 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  33.14 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  39.13 
 
 
214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  39.44 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  34.92 
 
 
189 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.9 
 
 
191 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  34.3 
 
 
188 aa  112  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  34.21 
 
 
189 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  33.16 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  35.29 
 
 
189 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  31.79 
 
 
183 aa  104  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  32.34 
 
 
192 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  34.71 
 
 
184 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  33.69 
 
 
189 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  28.45 
 
 
345 aa  101  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  32.37 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  31.21 
 
 
188 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  29.68 
 
 
287 aa  94.4  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.65 
 
 
163 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.47 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  30.21 
 
 
245 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.22 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.16 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  27.49 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  31.05 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  32.77 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  25.75 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.05 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  28.99 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.54 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.02 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  25.5 
 
 
277 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.05 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.5 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  27.62 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  28.57 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  32.54 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.5 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  27.87 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.9 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.22 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.22 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.26 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.01 
 
 
334 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.97 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.11 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  29.03 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  26.57 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  27.88 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  31.11 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.01 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  28.57 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.26 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  26.02 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.82 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  27.32 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  30.11 
 
 
174 aa  72  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.64 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  28.71 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  25.68 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  25.68 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.11 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.81 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.99 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.2 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.99 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.51 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  32.37 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.26 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  26.51 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  26.8 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  26.44 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  26.74 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.27 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  25.68 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.32 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.07 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.8 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  27.27 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  25.7 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  26.74 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  25.14 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  27.47 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  24 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  25.81 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.56 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.57 
 
 
167 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  26.9 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.93 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  27.22 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  25.57 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  28.57 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  28.14 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>