288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0625 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  100 
 
 		 279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  52.55 
 
 		 273 aa  284  9e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  48.93 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  49.63 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  46.15 
 
 		 274 aa  272  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  45.02 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  45.32 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  35.66 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  35.66 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  32.45 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  32.96 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  33.98 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  31.82 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  32.71 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  29.63 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  33.2 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  32.54 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  32.47 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  34.7 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  33.45 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  31.82 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  31.09 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  32.61 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  31.14 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  32.12 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  30.04 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  29.26 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  30.04 
 
 		 278 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  30.15 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  31.25 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  32.08 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  29.32 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  28.63 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  31 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  29.41 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  27.27 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  30.68 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  29.56 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  26.62 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25.53 
 
 		 345 aa  89.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.39 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.6 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  25.93 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  29.55 
 
 		 184 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  27.07 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.67 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  25.82 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  26.26 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.32 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.84 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  27.62 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.18 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  27.84 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.14 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  26.23 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.21 
 
 		 171 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  21.31 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.59 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  26.44 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.21 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.12 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  25.82 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  22.54 
 
 		 185 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.58 
 
 		 188 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  26.44 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.12 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.59 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.32 
 
 		 168 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  27.84 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  29.53 
 
 		 185 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.56 
 
 		 163 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.24 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  24.02 
 
 		 175 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  24.38 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  22.16 
 
 		 169 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.24 
 
 		 214 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0032  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.33 
 
 		 61 aa  52.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  21.98 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  44.64 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 		 62 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000213739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  23.39 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.43 
 
 		 167 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.04 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  21.91 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  41.94 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  23.6 
 
 		 184 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.25 
 
 		 186 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  23.6 
 
 		 184 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  24.43 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 		 62 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  25 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  24.43 
 
 		 194 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  26.97 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2694  ferredoxin  47.06 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378888 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  43.86 
 
 		 498 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.98 
 
 		 190 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  22.16 
 
 		 178 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  34.52 
 
 		 507 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>