More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1135 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  100 
 
 		 272 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  97.06 
 
 		 272 aa  550  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  58.09 
 
 		 278 aa  343  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  54.58 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  35.96 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  29.33 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  26.86 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  28.67 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  30.6 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  26.67 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  26.24 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  29.41 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  26.33 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  28.52 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.48 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  27.5 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  29.78 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  25.18 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  26.41 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  26.15 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  24.21 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  29.09 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  29.89 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  25.72 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  22.78 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  25.09 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  27.57 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  24.56 
 
 		 275 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  25.26 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  26.99 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  26.92 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  25.81 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25.91 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  24.82 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  23.42 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  25.18 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  26.69 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  24.82 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  24.32 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  23.57 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.14 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.57 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.5 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.51 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.7 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.06 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.62 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.53 
 
 		 186 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.27 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.06 
 
 		 57 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.38 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.62 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  46.55 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.15 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.98 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.94 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  27.09 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.45 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.23 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.04 
 
 		 167 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.27 
 
 		 176 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25.13 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  20.83 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.25 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.6 
 
 		 178 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.77 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  25.99 
 
 		 167 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.04 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 		 368 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  26.18 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  25.95 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  25.95 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.85 
 
 		 443 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25.74 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.43 
 
 		 748 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  42.11 
 
 		 448 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  39.06 
 
 		 443 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.17 
 
 		 183 aa  53.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  35.53 
 
 		 460 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0552  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  46 
 
 		 786 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0563725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.56 
 
 		 367 aa  52.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2193  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 60 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  32.31 
 
 		 577 aa  52.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  33.8 
 
 		 418 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 		 57 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  25.13 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2618  sulfite reductase, beta subunit  43.4 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.433957 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 57 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0761  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.33 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  26.53 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.241383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  44 
 
 		 639 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  23.78 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.45 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0075  coenzyme F420 hydrogenase  46.81 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  28.08 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  24.18 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>