290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  42.51 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  32.6 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  32.75 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  38.16 
 
 		 188 aa  98.2  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  36.84 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  30.18 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  33.55 
 
 		 188 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.78 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.94 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  30.46 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.47 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  30.72 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.47 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  31.82 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  29.38 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  30.56 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.27 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.4 
 
 		 334 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.43 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.67 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  30.11 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.56 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.83 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  33.61 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  30.4 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  25.95 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  25.27 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.95 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.14 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.48 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  31.98 
 
 		 273 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.09 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  24.18 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  25.54 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.66 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.88 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25.54 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.38 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.69 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.28 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  27.54 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.33 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.17 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  27.95 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  30.99 
 
 		 867 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  30.3 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.11 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.71 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.44 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.75 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.2 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  30 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.1 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  29.01 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.24 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.83 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.15 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  24.69 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.38 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.33 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.05 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.71 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  32.81 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.38 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.27 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.57 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.26 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.51 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.51 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.17 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  27.98 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  25.71 
 
 		 275 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.54 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  27.84 
 
 		 286 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.75 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  25.64 
 
 		 246 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0061  nitroreductase  28.23 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.84 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.15 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  27.97 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.92 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  26.88 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.48 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  29.45 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  30.23 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  26.56 
 
 		 446 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  26.19 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  26.01 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  25.95 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.07 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  29.07 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  30.49 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.27 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>