More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1862 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  100 
 
 
197 aa  401  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  55.73 
 
 
201 aa  228  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  38.69 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  38.69 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35.15 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  39.41 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  33.94 
 
 
173 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  34.55 
 
 
173 aa  124  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.71 
 
 
174 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  36.36 
 
 
169 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  37.65 
 
 
169 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  32.73 
 
 
173 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  33.33 
 
 
173 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  36.47 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  36.47 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  34.32 
 
 
167 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  37.65 
 
 
169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.15 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  35.09 
 
 
169 aa  111  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  32.16 
 
 
187 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  34.5 
 
 
169 aa  110  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  32.1 
 
 
169 aa  109  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  32.35 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  34.12 
 
 
174 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.91 
 
 
166 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  35.96 
 
 
274 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.56 
 
 
169 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  34.76 
 
 
166 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.48 
 
 
165 aa  101  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  29.82 
 
 
171 aa  99  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  32.75 
 
 
170 aa  99  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.34 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  39.35 
 
 
167 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.41 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  33.93 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.31 
 
 
175 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  31.4 
 
 
169 aa  92  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.99 
 
 
174 aa  91.3  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  36.2 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.95 
 
 
186 aa  88.2  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.5 
 
 
170 aa  87.8  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.12 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.46 
 
 
178 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  31.74 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.03 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.16 
 
 
167 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  31.25 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.95 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.53 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.41 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.21 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.55 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.57 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.76 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.88 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  33.54 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  26.86 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  34.55 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  30.41 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.07 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.74 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  32.9 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  33.95 
 
 
172 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.67 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.34 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.29 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  26.88 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.48 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.43 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.1 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  28.65 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.09 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.95 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.43 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  31.68 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  31.52 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  29.38 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  32.2 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  29.94 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  26.55 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.95 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.74 
 
 
173 aa  72  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  30.91 
 
 
321 aa  71.2  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  27.92 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  27.93 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.1 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.27 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.41 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.06 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  30.43 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.27 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>