More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1376 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  96.91 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  81.36 
 
 		 178 aa  315  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  50.86 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  45.51 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  50 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  48.11 
 
 		 186 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  46.74 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  46.2 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  46.24 
 
 		 170 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  44.09 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  44.89 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  40.48 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  39.88 
 
 		 163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  39.88 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  37.99 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  41.36 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  31.64 
 
 		 180 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  36.1 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  37.64 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  36.46 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  35.8 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  38.6 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  34.94 
 
 		 278 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  36.51 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  36.67 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  36.67 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  36.99 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.13 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  35.14 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  37.85 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  37.43 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  33.53 
 
 		 329 aa  99.4  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  37.08 
 
 		 169 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32.94 
 
 		 175 aa  99  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.57 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  34.59 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  37.27 
 
 		 175 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  35.71 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  35.71 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  35.03 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  33.33 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  35.26 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  35.71 
 
 		 169 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  29.71 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.64 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  35.59 
 
 		 169 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  33.73 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  30.33 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  30.33 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  30.33 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  30.33 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  38.42 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  30.1 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  34.25 
 
 		 172 aa  92  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  31.43 
 
 		 173 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  31.13 
 
 		 215 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  32.56 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.5 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  34.29 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  29.86 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  30.66 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.33 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.33 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  34.32 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  30.66 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.12 
 
 		 171 aa  88.6  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.38 
 
 		 170 aa  88.2  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  32.4 
 
 		 274 aa  88.2  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  35.76 
 
 		 169 aa  88.2  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35.67 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  28.57 
 
 		 215 aa  87  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  33.76 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  35.87 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  33.87 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  33.87 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  33.87 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  33.87 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  33.87 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  33.87 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  33.87 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  33.33 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  29.72 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  32.28 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  32.18 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.23 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  32.26 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.41 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  26.99 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  28.16 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  34.78 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  31.18 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  30.65 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.74 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  31.72 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.76 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>