More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0813 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  47.93 
 
 
174 aa  150  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  43.27 
 
 
170 aa  130  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  39.88 
 
 
329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  48.21 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  45.61 
 
 
175 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  47.34 
 
 
174 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  43.83 
 
 
175 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  38.69 
 
 
215 aa  121  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  44.1 
 
 
192 aa  120  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  37.5 
 
 
214 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  42.26 
 
 
175 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  38.25 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  44.44 
 
 
175 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  35.11 
 
 
186 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  35.12 
 
 
176 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  33.14 
 
 
178 aa  101  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  34.97 
 
 
186 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.95 
 
 
176 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  35.52 
 
 
184 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32 
 
 
194 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  34.32 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.94 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32 
 
 
194 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  36.02 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  36.21 
 
 
178 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  33.33 
 
 
174 aa  90.5  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.91 
 
 
179 aa  89  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.18 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.7 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  31.76 
 
 
240 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  30.59 
 
 
257 aa  84.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  33.33 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.14 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  33.72 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.91 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  31.07 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  33.14 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.07 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.98 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.74 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.82 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  32.45 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  36.9 
 
 
273 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  33.33 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  40 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  35 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  32.52 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  32.73 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.5 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  35.71 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.72 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.47 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  32.56 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  33.14 
 
 
265 aa  74.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  31.4 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  28.98 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  30.82 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.43 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  28.85 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  30 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  33.92 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  33.74 
 
 
282 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  29.88 
 
 
251 aa  71.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  28.83 
 
 
240 aa  70.9  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.99 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.94 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.32 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.67 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  32.03 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.89 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  27.72 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.5 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  31.64 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  29.94 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  30.69 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.56 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  32 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  29.19 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2554  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.14 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  32.67 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  35.63 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  32.18 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.41 
 
 
219 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  26.29 
 
 
248 aa  67.8  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.38 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33 
 
 
240 aa  67.4  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  28.14 
 
 
261 aa  67.4  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.57 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.46 
 
 
214 aa  67  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  28.83 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.44 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  36.47 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 
814 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  28.06 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  25.16 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.83 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.83 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.67 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>