More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0739 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  56.8 
 
 
171 aa  221  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  55.88 
 
 
173 aa  218  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  55.76 
 
 
168 aa  206  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  56.21 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  42.94 
 
 
165 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  43.12 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  37.95 
 
 
166 aa  132  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.97 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  35.19 
 
 
278 aa  111  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  34.12 
 
 
170 aa  108  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.13 
 
 
166 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.33 
 
 
187 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.91 
 
 
174 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  33.33 
 
 
171 aa  101  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  32.53 
 
 
166 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  33.94 
 
 
174 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.53 
 
 
177 aa  97.8  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  34.16 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  36.55 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  34.01 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.54 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  29.17 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.78 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.23 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  30.19 
 
 
172 aa  90.9  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.17 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.57 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.63 
 
 
204 aa  89  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30.34 
 
 
169 aa  89  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.98 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.25 
 
 
169 aa  88.2  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.19 
 
 
163 aa  87.8  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  32.76 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  32.45 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.87 
 
 
169 aa  87.8  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.65 
 
 
171 aa  87  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  31.13 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.92 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  29.17 
 
 
196 aa  85.5  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  31.95 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  34.03 
 
 
169 aa  85.1  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.49 
 
 
191 aa  85.1  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.65 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.7 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  32.14 
 
 
189 aa  84.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.76 
 
 
175 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  36.09 
 
 
174 aa  84.3  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.81 
 
 
194 aa  84.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.49 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.49 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  31.33 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  30.23 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.39 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  31.55 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  31.76 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  34.94 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  34.42 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.19 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.29 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.89 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  29.8 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.61 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  29.48 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  31.08 
 
 
274 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.57 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  30.95 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  30.61 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.6 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  36.99 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  32.28 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  27.89 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  31.76 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.02 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  29.49 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.24 
 
 
202 aa  77.4  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.17 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  32.26 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.33 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.19 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  31.94 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  26.16 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.89 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.54 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  28.87 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  25.83 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.14 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  28.65 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  28.65 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  29.14 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.3 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  25.97 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.3 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.31 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  29.38 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  26.49 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  30.91 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  30.14 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  27.98 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>