More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0804 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  55.98 
 
 
182 aa  206  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  36.84 
 
 
205 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  38.01 
 
 
217 aa  121  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  40.23 
 
 
223 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  39.31 
 
 
209 aa  117  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  36.57 
 
 
227 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  35.2 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  34.83 
 
 
223 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  35.06 
 
 
224 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  34.27 
 
 
223 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  31.35 
 
 
224 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  36.87 
 
 
226 aa  98.6  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  33.15 
 
 
224 aa  98.2  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  33.33 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  31.98 
 
 
230 aa  84.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  32 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  35.43 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  32.76 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.8 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.8 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.32 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.32 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.51 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  34.27 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.65 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  28.65 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.94 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.86 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.51 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.32 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.23 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.92 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  27.75 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.49 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.39 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.78 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  26.34 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.84 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  29.08 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  29.08 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  29.08 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.9 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  29.08 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.63 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  29.34 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  28.74 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.5 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  27.54 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  28.14 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  25.25 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  27.64 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  27.62 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  27.62 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.17 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  25.77 
 
 
167 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  28.42 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  28.06 
 
 
215 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.32 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  27.14 
 
 
215 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.17 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  24.86 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  28.14 
 
 
215 aa  61.6  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  25.37 
 
 
234 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  24.73 
 
 
213 aa  61.2  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  24.08 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.26 
 
 
218 aa  61.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.86 
 
 
184 aa  61.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  24.55 
 
 
170 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  31.25 
 
 
189 aa  60.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0993  nitroreductase family protein  27.22 
 
 
266 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1054  nitroreductase family protein  27.22 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.17 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  28.57 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  24 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.31 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  23.38 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  27.27 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.18 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.29 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.27 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.82 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  28.49 
 
 
275 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  29.69 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  28.33 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.27 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  23.43 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  28.57 
 
 
274 aa  58.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.78 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  22.47 
 
 
206 aa  58.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  27.22 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  24 
 
 
202 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4520  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.28 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  32.12 
 
 
277 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  24.06 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.9 
 
 
330 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.32 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  25.54 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>