More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1387 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  100 
 
 
170 aa  345  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  63.1 
 
 
170 aa  228  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  58.08 
 
 
176 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  56.29 
 
 
172 aa  207  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  55.09 
 
 
172 aa  204  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  54.49 
 
 
195 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  57.49 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  52.1 
 
 
176 aa  193  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  53.53 
 
 
173 aa  190  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  47.9 
 
 
173 aa  167  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  51.5 
 
 
175 aa  163  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  49.67 
 
 
176 aa  158  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  39.39 
 
 
184 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  39.52 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  35.93 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  38.06 
 
 
169 aa  105  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  34.38 
 
 
171 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  97.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.36 
 
 
170 aa  95.1  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.45 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.45 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  33.97 
 
 
169 aa  94  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  32.28 
 
 
169 aa  94  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  36.42 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.75 
 
 
178 aa  92  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  35.29 
 
 
170 aa  90.9  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  38 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  33.12 
 
 
278 aa  90.5  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  32.68 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30.81 
 
 
174 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.68 
 
 
168 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.97 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.54 
 
 
176 aa  84.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  29.94 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.94 
 
 
169 aa  84  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.54 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  34.73 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  28.39 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.07 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  30.64 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.07 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  31.79 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.85 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.52 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.52 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.99 
 
 
187 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  31.52 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  33.33 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.52 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.65 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  29.34 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.04 
 
 
186 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.03 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  29.34 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.14 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.78 
 
 
194 aa  77.4  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  31.29 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.63 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  28.65 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  29.01 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.19 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.21 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.01 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.32 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.38 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.46 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.16 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.22 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.52 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  28.49 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.6 
 
 
190 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.09 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.25 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  25.29 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  27.01 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25.29 
 
 
214 aa  70.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.67 
 
 
202 aa  70.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  27.53 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.88 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.63 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.75 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  29.31 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  30.77 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  31.41 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.65 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.76 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  25 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  30.06 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  26.67 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.17 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.81 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  31.45 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.46 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  25.17 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  28.8 
 
 
348 aa  63.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.9 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.49 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  27.06 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>