More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0706 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  100 
 
 
168 aa  349  8.999999999999999e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  62.5 
 
 
171 aa  229  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  55.76 
 
 
176 aa  206  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  56.36 
 
 
173 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  52.1 
 
 
176 aa  187  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  38.99 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  34.62 
 
 
166 aa  121  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  38.27 
 
 
170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  32.93 
 
 
169 aa  104  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  31.91 
 
 
163 aa  97.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.76 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  35.37 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.37 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30.12 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  33.96 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.99 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.94 
 
 
187 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.68 
 
 
176 aa  91.3  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.42 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.45 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.83 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.03 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.82 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.46 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.24 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.2 
 
 
182 aa  84.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  31.76 
 
 
169 aa  84.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.17 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.22 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.14 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  30.06 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.22 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  26.9 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  26.9 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  25.88 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.59 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  31.58 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  30.38 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  29.83 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.44 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  34.68 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.93 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  29.75 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.62 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  29.11 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.95 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.91 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  26.92 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  34.51 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.49 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  31.69 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  29.7 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  27.65 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  24 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.25 
 
 
201 aa  74.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  28.12 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.28 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  28.57 
 
 
191 aa  73.9  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  34.9 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  31.82 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.09 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.4 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  28.1 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.35 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.57 
 
 
278 aa  71.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.74 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.53 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.98 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  27.63 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  30.3 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  26.53 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  25.44 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.57 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.81 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  30.87 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  25.68 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  29.5 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25.68 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  28.19 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  28.48 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.03 
 
 
180 aa  67.4  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.3 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0639  nitroreductase  31.06 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  24.85 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.89 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  24.67 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.5 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  26.85 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.69 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.66 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.31 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.5 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  25.93 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  23.76 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.06 
 
 
202 aa  63.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  29.58 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  25.53 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>