More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0470 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  52.12 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  47.95 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  51.52 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  48.48 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  49.12 
 
 		 173 aa  160  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  48.19 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  45.29 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  47.65 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  49.12 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  38.12 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.25 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.1 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  34.34 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  31.69 
 
 		 168 aa  87.8  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  33.55 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  37.27 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  36.36 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.02 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  32.69 
 
 		 166 aa  85.1  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35.58 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.75 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  30.26 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.07 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.3 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  31.48 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  31.03 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.48 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  36.67 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.83 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  37.16 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.96 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  36.42 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.16 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  32.12 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  32.12 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.21 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.28 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.87 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  30.91 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.07 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.69 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  31.07 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.12 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  31.45 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.05 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  31.29 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.41 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  33.99 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  33.73 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  30.52 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.16 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.33 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  26.13 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.24 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.57 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.03 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.52 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  32 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  34.78 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.05 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.92 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.87 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  24.88 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.57 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  26.44 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  31.82 
 
 		 431 aa  67.8  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.57 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.87 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.91 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  27.91 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  27.16 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36.25 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.87 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  26.09 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  29.69 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  31.51 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  29.84 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.5 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  29.24 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.58 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.73 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  30.13 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.63 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  26.67 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.36 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.02 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.57 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  28.65 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.14 
 
 		 526 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.57 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.83 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.32 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  24.02 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.25 
 
 		 423 aa  60.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  28.95 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  30.26 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  29.07 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.49 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  29.89 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>