More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1568 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  47.59 
 
 
184 aa  158  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  39.25 
 
 
183 aa  154  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  36.96 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  39.06 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  38.02 
 
 
189 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  41.06 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  38.54 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  37.16 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  34.97 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  33.68 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  38.17 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.94 
 
 
188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.86 
 
 
187 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  36.09 
 
 
191 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  36.09 
 
 
214 aa  117  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  34.41 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  33.68 
 
 
202 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  30.9 
 
 
194 aa  115  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  38.41 
 
 
163 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  33.51 
 
 
185 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  35.47 
 
 
169 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  30.81 
 
 
189 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  32.37 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  36.84 
 
 
187 aa  97.8  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30.49 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  32.39 
 
 
173 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.95 
 
 
174 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.52 
 
 
166 aa  91.3  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  36 
 
 
176 aa  91.3  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  33.52 
 
 
173 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  30.06 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  33.33 
 
 
171 aa  89.4  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  31.25 
 
 
173 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  87.8  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  35.29 
 
 
169 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32.37 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.12 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  32.96 
 
 
173 aa  86.3  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  28.91 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.41 
 
 
165 aa  85.5  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.49 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  32.53 
 
 
173 aa  84.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  34.08 
 
 
274 aa  84.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.89 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25.76 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  32.34 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  32.34 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  31.67 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  31.76 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  31.25 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.55 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  27.84 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  34.25 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.72 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  29.78 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.67 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.39 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  28.26 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  30.11 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  31.58 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.33 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  25.81 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  29.57 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  32.57 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  33.16 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.83 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.28 
 
 
194 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  27.72 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  34.43 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  28.24 
 
 
334 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.61 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  33.15 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  31.79 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.65 
 
 
170 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.46 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.96 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.46 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  30.39 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  29.65 
 
 
272 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  24.76 
 
 
287 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.49 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  31.95 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.36 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  27.27 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  29.76 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.81 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.95 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.19 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.48 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.84 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  30.29 
 
 
173 aa  72  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  28.83 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  33.06 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  25 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  28.72 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.89 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.14 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.69 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>