249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3021 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  51.33 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  44.19 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  39.05 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  41.24 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  38.69 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  39.34 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  35.9 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  36 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  36.63 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  34.67 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  35.56 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  33.33 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  36.5 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  34.19 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  33.7 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  33.94 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  34.67 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  31.02 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  32.85 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  36.07 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  36.56 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  34.42 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  28.52 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  32.6 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  28.72 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  31.25 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  33.72 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  30.63 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  25.89 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  29.96 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  28.62 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  31.85 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  26.24 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  31.91 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  29.09 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.46 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.28 
 
 		 334 aa  86.3  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.39 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.26 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.79 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  31.29 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  28.83 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  27.03 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.44 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  23.37 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  27.27 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  26.42 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  28.73 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.78 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.26 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  26.19 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.78 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.71 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  30.66 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.09 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  27.22 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  26.35 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  25.27 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.61 
 
 		 165 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.83 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  26.79 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  28.4 
 
 		 172 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.5 
 
 		 194 aa  62  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  23.16 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.26 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.38 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.98 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.98 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.61 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.59 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.91 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  24.54 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  23.19 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  23.64 
 
 		 176 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.16 
 
 		 170 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  26.9 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.53 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  24.46 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.27 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  27.17 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  25.93 
 
 		 169 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.04 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.83 
 
 		 174 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.57 
 
 		 185 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  24.86 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  20.83 
 
 		 185 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  22.67 
 
 		 167 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  27.72 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.28 
 
 		 194 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  24.17 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  26.52 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25.28 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  23.9 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  27.06 
 
 		 169 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>