More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0660 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  100 
 
 		 189 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  64.52 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  62.9 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  62.37 
 
 		 188 aa  245  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  36.96 
 
 		 191 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  39.57 
 
 		 189 aa  141  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  37.31 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  37.17 
 
 		 189 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  37.97 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  37.57 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  39.29 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  35.67 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  34.92 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  30.81 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  35.67 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  33.33 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  32.6 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  32.98 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.51 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.51 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  31.91 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  30.27 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.82 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  30.39 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  32.95 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  28.79 
 
 		 345 aa  87.8  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  31.87 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  37.12 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  37.12 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.65 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  29.09 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  28.72 
 
 		 245 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  31.07 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  35.11 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.37 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  31.76 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  29.82 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.9 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30.46 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.29 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  30.73 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  30.17 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  26.4 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.36 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  34.33 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.98 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.31 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  32.33 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.8 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.6 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  26.37 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  28.74 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  30.1 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  33.69 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.93 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.73 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  27.57 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.9 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.41 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.8 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  28 
 
 		 273 aa  68.2  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.08 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  27.38 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.77 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  30.08 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  26.78 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  30.5 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  26.14 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  25.44 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.95 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.71 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  27.84 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  29.17 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  28.99 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  27.84 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  25.4 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  27.96 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  24.29 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.49 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.26 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  27.81 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  24.86 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.23 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.58 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.83 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  32.31 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.77 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.68 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.54 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.47 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.64 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  28.02 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  34.31 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.14 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  29.44 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  26.82 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  36 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>