More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3073 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  64.82 
 
 		 200 aa  266  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  47.64 
 
 		 184 aa  154  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  41.49 
 
 		 192 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  40 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  39.04 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  38.95 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  37.57 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  39.15 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  38.6 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  35.14 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  34.63 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  32.76 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  36.14 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  34.34 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  34.71 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  31.88 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  31.89 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  31.4 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  28.11 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  29.83 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  29.79 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  32.93 
 
 		 187 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  28.57 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  33.15 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  29.28 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  36.24 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  29.35 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  30.73 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  30.39 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0173  nitroreductase  33.52 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  35.59 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  28.75 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  30.81 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  30.95 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  27.62 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  27.62 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  27.62 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  28.75 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  28.75 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  29.94 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  25.95 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  28.12 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.42 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  33.89 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  31.28 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  32.69 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  32.05 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  33.33 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.58 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  27.61 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  28.81 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  29.94 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  31.9 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  33.71 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  32.2 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  25.97 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  30.39 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  28.49 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.67 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  27.07 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  32.73 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  29.79 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  31.52 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  28.4 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  28.43 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  28.4 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.02 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  29.94 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  28.4 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  29.11 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  29.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  29.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  29.03 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  32.2 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  27.27 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  32.2 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  31.64 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  25.99 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  28.09 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  28.82 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  31.64 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>