180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0498 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  99.45 
 
 
183 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  49.72 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  36.31 
 
 
188 aa  105  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  37.72 
 
 
195 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  30.41 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  29.7 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  28.4 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  33.53 
 
 
185 aa  72  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  30.91 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  28.65 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  27.68 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  28.05 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  28.14 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  28.57 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  27.54 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  27.54 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  27.54 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  27.54 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  27.54 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  26.95 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  29.55 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  26.95 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  27.54 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  27.44 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  27.54 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  26.51 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  25.42 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  25.77 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.55 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.07 
 
 
190 aa  58.9  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  26.54 
 
 
235 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  26.63 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  25.88 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  23.56 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  25.77 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  25.77 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  25.77 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  25.15 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  25.77 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  25.15 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0639  nitroreductase  25.82 
 
 
161 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.18 
 
 
217 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  23.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  23.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  23.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  23.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.48 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  23.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  23.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  23.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  23.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  23.64 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  24.71 
 
 
219 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  23.93 
 
 
183 aa  54.3  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1233  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.96 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  23.6 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  24.67 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  24.54 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  22.42 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1674  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.98 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505053  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  23.96 
 
 
461 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.98 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  24.58 
 
 
219 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47750  hypothetical protein  26.96 
 
 
218 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327948  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2149  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.57 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0566543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  24.54 
 
 
183 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  24.39 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  26.35 
 
 
192 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.97 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  26.14 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  25.93 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  24.69 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  22.89 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  29.37 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  24.06 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0482  nitroreductase family protein  25.45 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.53 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  24.69 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.42 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  21.69 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  21.21 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  24.88 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  24.59 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  27.54 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  24.26 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  21.21 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  21.21 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  21.21 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  21.21 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  25.61 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4116  hypothetical protein  25.25 
 
 
218 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.19 
 
 
215 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2763  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.78 
 
 
228 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0692468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  24.32 
 
 
200 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0837  nitroreductase family protein  27.64 
 
 
151 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89702e-58 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  26.39 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.47 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.1 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  22.7 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>