270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3170 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  100 
 
 		 210 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  43.01 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  39.69 
 
 		 192 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  40.53 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  33.33 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  35.11 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  34.3 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  33.33 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  32.45 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  31.88 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  28.57 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  28.27 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  28.27 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  27.72 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  28.04 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  30.73 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  26.88 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  29.63 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  28.65 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  30.36 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  27.23 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  28.42 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  27.51 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  30.43 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  29.13 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  29.59 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  30.16 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  29.02 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  30.41 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  30.41 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  29.55 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  27.49 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  29.05 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  29.55 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  29.27 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  28.67 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  27.98 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  29.41 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  28.1 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.79 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  25 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  28.66 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  28.74 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  27.95 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  27.46 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  29.19 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  24.7 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  24.7 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  24.7 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  29.66 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  26.06 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1683  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.07 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000634411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  22.75 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  30.98 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  27.75 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  22.45 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  27.33 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  29.19 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  30.34 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  22.02 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.96 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.38 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7206  nitroreductase  25.4 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  26.45 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.79 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.34 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7274  nitroreductase  29.88 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573924  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.61 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.75 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  30.07 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1004  nitroreductase  26.38 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  28.16 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  23.95 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  25.65 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  27.03 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  24.48 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2175  nitroreductase  23.23 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  25.82 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  25.14 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  25.17 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2320  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  26.02 
 
 		 1580 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.65 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  28.03 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.62 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  25.17 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  24.83 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  24.83 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  27.39 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  25.17 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  24.83 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  24.83 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2149  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.99 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566543 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  25.17 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  25.17 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>