More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0893 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  100 
 
 
187 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  57.22 
 
 
196 aa  245  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  49.7 
 
 
190 aa  178  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  48.5 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  38.92 
 
 
194 aa  154  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  42.31 
 
 
191 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  42.31 
 
 
214 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  43.41 
 
 
189 aa  141  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  40.48 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  39.46 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  39.89 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  37.23 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  37.77 
 
 
189 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  38.3 
 
 
184 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.86 
 
 
191 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.91 
 
 
188 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  36.51 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.25 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  35.67 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  36.84 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  36.84 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  33.84 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  35.09 
 
 
188 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.79 
 
 
345 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.33 
 
 
176 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  36.32 
 
 
170 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  32.75 
 
 
174 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  33.67 
 
 
186 aa  101  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  35.39 
 
 
190 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.85 
 
 
167 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.15 
 
 
167 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.8 
 
 
177 aa  98.6  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  33.92 
 
 
169 aa  97.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.63 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.69 
 
 
196 aa  96.3  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  31.88 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  34.74 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.65 
 
 
166 aa  95.9  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.58 
 
 
168 aa  96.3  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  34.91 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  35.26 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  30.54 
 
 
163 aa  95.5  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  28.42 
 
 
287 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  33.53 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  35.29 
 
 
178 aa  95.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  29.72 
 
 
252 aa  94.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.88 
 
 
170 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  33.68 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.65 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  29.17 
 
 
274 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  27.27 
 
 
275 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.64 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  32.56 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.95 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.83 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  33.53 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  32.04 
 
 
263 aa  92  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  30.94 
 
 
168 aa  92  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.65 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.22 
 
 
171 aa  91.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.03 
 
 
169 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.69 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
163 aa  91.3  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.62 
 
 
245 aa  90.9  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  29.48 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  27.65 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  31.52 
 
 
169 aa  89.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.86 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.63 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.96 
 
 
173 aa  89  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  28.57 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.67 
 
 
173 aa  87.8  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  31.09 
 
 
180 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  26.74 
 
 
274 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.7 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  31.55 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  31.03 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.31 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.94 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.02 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  30.73 
 
 
215 aa  84.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  29.03 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  28.5 
 
 
273 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  27.23 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.36 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.77 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  32.74 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.74 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.43 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.82 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  30.59 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  29.76 
 
 
215 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  31.43 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  26.86 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.59 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  31.74 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  29.65 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>