More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1490 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  100 
 
 		 275 aa  567  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  42.7 
 
 		 277 aa  240  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  36.4 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  36.13 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  39.34 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  36.3 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  38.52 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  35.87 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  34.07 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  35.87 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  33.46 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  33.82 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  35.56 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  34.07 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  32.59 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  31.11 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  31.99 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  30.86 
 
 		 274 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  30.58 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  30.63 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  31.23 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  34.91 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  31.56 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  32.97 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  29.63 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  28.41 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  30.11 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  30.48 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  29.04 
 
 		 284 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  28.57 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  29.21 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  22.42 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.35 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.72 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  22.78 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  27.14 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  21.55 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  24.49 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  26.6 
 
 		 295 aa  92.4  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  27.65 
 
 		 303 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25 
 
 		 345 aa  89.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.23 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.65 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.04 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.96 
 
 		 174 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.77 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.98 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.11 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.03 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.06 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.37 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  28.04 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.37 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.93 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  25.42 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  26.4 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.56 
 
 		 178 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.8 
 
 		 166 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  26.94 
 
 		 189 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  24.35 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  26.32 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  25 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.04 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  24.87 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  22.67 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  26.42 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  29.08 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.11 
 
 		 163 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  26.16 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  22.56 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.26 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  26.7 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.18 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  26.6 
 
 		 166 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  23.86 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  24.88 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.39 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  24.47 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.14 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  26.06 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  24.47 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  28.4 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  28.36 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  22.65 
 
 		 176 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  21.91 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  24.43 
 
 		 172 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  21.35 
 
 		 182 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  24.58 
 
 		 184 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  21.51 
 
 		 170 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  22.83 
 
 		 184 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  24.1 
 
 		 183 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  24.44 
 
 		 183 aa  53.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  21.02 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  25.54 
 
 		 171 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.26 
 
 		 73 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.859312  normal  0.859235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  24.72 
 
 		 184 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>