More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0116 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  56.22 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  44.4 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  36.56 
 
 		 345 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.72 
 
 		 187 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  31.36 
 
 		 287 aa  92.4  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.21 
 
 		 202 aa  92  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  33.66 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.25 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  32.58 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.92 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.6 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.44 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.94 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.54 
 
 		 194 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  28.65 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  30.3 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  26.64 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  30.3 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.17 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  30.72 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.22 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.74 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.56 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.57 
 
 		 174 aa  72  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.76 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.82 
 
 		 176 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.63 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  26.51 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.71 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  28.31 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  33.73 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25.85 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25.46 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  31.4 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.35 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  32.21 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  25.73 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.22 
 
 		 176 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.36 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.22 
 
 		 163 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  32.34 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  28.9 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.63 
 
 		 165 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  29.48 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.49 
 
 		 194 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.37 
 
 		 170 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.32 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  30 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.47 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  26.44 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.28 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.17 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.36 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  26.11 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.84 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.84 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.84 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.94 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  28.85 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.33 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  29.41 
 
 		 189 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.84 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  29.77 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  28.23 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  29.34 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  26.57 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.73 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.74 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.74 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.6 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.19 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.89 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  34.32 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  28.24 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.05 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.47 
 
 		 584 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.89 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  27.54 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  24.77 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.38 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  24.89 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.89 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  52.94 
 
 		 232 aa  62  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25.89 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  26.82 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  29.01 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  27.5 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.2 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  28.78 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  27.1 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  24.5 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  28 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  27.57 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  50.98 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  31.65 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  51.06 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  45 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  25.7 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>