More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3917 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  51.21 
 
 		 241 aa  195  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  50.97 
 
 		 226 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  50.97 
 
 		 226 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  50.97 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  51.46 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  39.25 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  36.74 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  38.6 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  36.62 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  33.02 
 
 		 546 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  30.99 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  31.65 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  32.16 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  29.55 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.83 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  29.86 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  30.37 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  33.33 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  31.44 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.78 
 
 		 176 aa  85.1  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  30.37 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  31.46 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  30.41 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  30.77 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  31.05 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  31.05 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  32.71 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  31.05 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  26.52 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  31.19 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.65 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  30.35 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.96 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.86 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.46 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.18 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  30.41 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.48 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.95 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.37 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.47 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.42 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.86 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.86 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.7 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.19 
 
 		 186 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.96 
 
 		 174 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  29.49 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.46 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.09 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.05 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.28 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.82 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  29.68 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.89 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  30.69 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.35 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.05 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.05 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.43 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.05 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.05 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  26.05 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  26.05 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.38 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  29.95 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.75 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  29.61 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  32.76 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  30.09 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.58 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.64 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.36 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.47 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.64 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  28.7 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  28.57 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  24.65 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  29.15 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.72 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.95 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.35 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.58 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  24.48 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  24.64 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  21.82 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.23 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  27.71 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  33.88 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.5 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25.12 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.35 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.72 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.87 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27.8 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  29.9 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  27.93 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>