192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4554 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  81.28 
 
 
225 aa  367  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  67.12 
 
 
236 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  57.47 
 
 
224 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  41.67 
 
 
546 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  32.74 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  35.19 
 
 
218 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  29.86 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  31.51 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.05 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  29.25 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.85 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.61 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  28.51 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  27.93 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  28.04 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  29.6 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.51 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.46 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  25.77 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  30.73 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  30.73 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  30.56 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  23.3 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  28.29 
 
 
274 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  29.44 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.4 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  21.96 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  25.57 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.61 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  22.58 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  29.29 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.32 
 
 
174 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.88 
 
 
190 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.23 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.57 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  27.52 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.5 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.36 
 
 
184 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  23.61 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.3 
 
 
170 aa  55.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  21.86 
 
 
165 aa  55.1  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  32.35 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  39.66 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  28.7 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  27.92 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  29.19 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  27.23 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  25.24 
 
 
273 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  25.55 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.21 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  23.67 
 
 
169 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.21 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.49 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  26.98 
 
 
228 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  29.9 
 
 
195 aa  51.6  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  37.29 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  25.66 
 
 
169 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  48 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  35.59 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  24.14 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.77 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  25.84 
 
 
329 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  25.21 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  24.1 
 
 
274 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  25.24 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  23.56 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  26.94 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.02 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  25.7 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.5 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.26 
 
 
584 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  22.07 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  25.86 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  27 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  21.78 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.94 
 
 
236 aa  48.9  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  26.7 
 
 
284 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  29.29 
 
 
272 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  21.78 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  21.78 
 
 
215 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  24.2 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  23.32 
 
 
166 aa  48.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  27.64 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  24.2 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  24.2 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.37 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  21.78 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  22.12 
 
 
187 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.94 
 
 
179 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  23.32 
 
 
166 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.9 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.32 
 
 
814 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  35.21 
 
 
178 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  25.77 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  24.04 
 
 
170 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  25.63 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  24.47 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  21.33 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>