194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1352 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  100 
 
 		 206 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  70.14 
 
 		 218 aa  284  8e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  59.62 
 
 		 223 aa  256  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  52.63 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  52.61 
 
 		 213 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  52.61 
 
 		 213 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  52.61 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  49.76 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  48.34 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  48.58 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  43.06 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  44.95 
 
 		 241 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  41.12 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  31.25 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.88 
 
 		 239 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  29.49 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  30.24 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  30.6 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  30.14 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  29.06 
 
 		 546 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  28 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  28 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  28 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  27.86 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.98 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  30 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  28.43 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.63 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  26.37 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.14 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.47 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.29 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  28.64 
 
 		 982 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  29.06 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.12 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.95 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  28.12 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.32 
 
 		 814 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  29.83 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.67 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  25.35 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  26.7 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  23.5 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.39 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.99 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  26.01 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  34.09 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  34.21 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  27.65 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  20.69 
 
 		 170 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.46 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  28.95 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.7 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  33.8 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.25 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.04 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  26.14 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.23 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  25 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  22.45 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  26.74 
 
 		 348 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  24.27 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  24.62 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.06 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  23.81 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  25.14 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  25.14 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  27.54 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  27.4 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  27.18 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  24.12 
 
 		 169 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  26.37 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  22.09 
 
 		 171 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  22.09 
 
 		 171 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.93 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  26.53 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  27.07 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  28.33 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  25.62 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  27.41 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  27.23 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.11 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  25.13 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  26.07 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47750  hypothetical protein  27.91 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  38.1 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  23.12 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  41.67 
 
 		 274 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.6 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  22.09 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.35 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  23.29 
 
 		 368 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  38.46 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.25 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.19 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>