More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3978 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  81.82 
 
 		 209 aa  350  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  56.1 
 
 		 350 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  58.82 
 
 		 348 aa  226  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  54.77 
 
 		 200 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.95 
 
 		 446 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  33.33 
 
 		 439 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  34.36 
 
 		 458 aa  104  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.42 
 
 		 423 aa  101  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  34.57 
 
 		 450 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 431 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.75 
 
 		 461 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.1 
 
 		 442 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.15 
 
 		 448 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.52 
 
 		 446 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.87 
 
 		 526 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.33 
 
 		 455 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.33 
 
 		 455 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 427 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.8 
 
 		 471 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  31.16 
 
 		 431 aa  84.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.98 
 
 		 463 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.36 
 
 		 430 aa  82.4  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.52 
 
 		 174 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.98 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.71 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  30.69 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  30.69 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  30.69 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  30.69 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  30.69 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.09 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.73 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  30.2 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  30.2 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  30.2 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  34.01 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  31.53 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.47 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  31.65 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.08 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30.21 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.65 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.14 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.51 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  33.33 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  28.71 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.28 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.53 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  30.73 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  30.05 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.63 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  29.08 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.68 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  28.22 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  30.95 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.49 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  32.07 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.02 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  34.25 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  32.56 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.73 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  26.15 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.36 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.05 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  28.57 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  27 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  26 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  32.99 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  34.12 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.53 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.5 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  27.23 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  32.46 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.75 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  30.48 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  50 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  27.67 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  26.07 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  27.23 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.94 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30.98 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  27.23 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.28 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1233  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.4 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25.94 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  29.9 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  25 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.73 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  28.39 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  30.41 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.6 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  28.35 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.02 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.59 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.02 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.03 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.37 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>