144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13404 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  67.91 
 
 
213 aa  307  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  67.91 
 
 
213 aa  307  9e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  67.91 
 
 
213 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  69.3 
 
 
213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  69.44 
 
 
213 aa  303  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  50.68 
 
 
223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  51.63 
 
 
228 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  50.23 
 
 
218 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  44.5 
 
 
215 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  43.24 
 
 
217 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  48.28 
 
 
206 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  42.24 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  30 
 
 
239 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  29.73 
 
 
234 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  33.18 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  32.55 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  29.52 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  30.81 
 
 
546 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  32.06 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  32.06 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  32.06 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  30.41 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  29.78 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  30.8 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  29.12 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  29.38 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  28.7 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  29.44 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.14 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.49 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.24 
 
 
186 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.19 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.8 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  27.5 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.83 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.96 
 
 
278 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  43.94 
 
 
270 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.2 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.34 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  26.54 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  25 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  42.42 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.71 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  29.63 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  22.82 
 
 
165 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  24.06 
 
 
170 aa  52.4  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  23.81 
 
 
170 aa  52.4  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  27.37 
 
 
450 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.06 
 
 
213 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  26.84 
 
 
196 aa  52  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  43.08 
 
 
231 aa  51.6  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.22 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  26.07 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.74 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.23 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 
982 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  31.03 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  27.66 
 
 
274 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.19 
 
 
287 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.92 
 
 
183 aa  48.5  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  38.16 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  24.64 
 
 
169 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  34.19 
 
 
209 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.06 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  26.78 
 
 
274 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  46.55 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  23.36 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  26.73 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.38 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  23.44 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  24.04 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.72 
 
 
176 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.6 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  21.8 
 
 
166 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  24.88 
 
 
184 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  40.3 
 
 
265 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  24.88 
 
 
184 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  25.82 
 
 
173 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  26.09 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3155  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.29 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  24.17 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  23.81 
 
 
169 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  26.37 
 
 
272 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  40 
 
 
174 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  22.22 
 
 
169 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  26.69 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  24.17 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.67 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  42.59 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  34.86 
 
 
186 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  41.67 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.25 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  34.72 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  38.03 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  28.65 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  22.61 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  27.98 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  35.48 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  23.96 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>