291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0106 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  39.25 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  34.08 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  33.92 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  35.07 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  36.15 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  33.64 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  34.32 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  33.17 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  33.17 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  33.17 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  34.58 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  30.73 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  30.73 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  34.15 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  30.28 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  33.18 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  31.31 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  33.06 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  31.92 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 		 546 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  29.19 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  31.56 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  29.03 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  30.56 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  26.05 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.63 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  29.24 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.69 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.8 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.46 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.88 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  26.67 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  29.6 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.02 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.65 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.63 
 
 		 324 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.18 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.27 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.12 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.51 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.78 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.93 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  25.33 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  25.13 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  29.05 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.5 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1863  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.94 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000280674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.18 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.02 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.07 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.32 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.62 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.46 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.63 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.98 
 
 		 170 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.63 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  24.39 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  26.21 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.1 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.63 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  29.11 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.28 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.88 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.56 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.78 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  27.63 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.47 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.08 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.08 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1683  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.52 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000634411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.93 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  25.22 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.27 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2042  nitroreductase  28.42 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1013  nitroreductase family protein  25.45 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.19 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.6 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.75 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  29.26 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.58 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.15 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.31 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  25.37 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.02 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  27.73 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.33 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  27.7 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  26.96 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.7 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.31 
 
 		 584 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0993  nitroreductase family protein  24.15 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1054  nitroreductase family protein  24.15 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  27.56 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.56 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>