154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0337 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  71.29 
 
 		 206 aa  285  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  58.22 
 
 		 223 aa  254  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  53.88 
 
 		 213 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  53.88 
 
 		 213 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  53.88 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  54.67 
 
 		 213 aa  214  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  54.29 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  50.46 
 
 		 213 aa  207  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  50 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  42.92 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  43.89 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  42.67 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  29.46 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.35 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  32.56 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  30.58 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.67 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  28.44 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  28.5 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  30.48 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 		 546 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  29.13 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  29.13 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  29.13 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  30 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  29.32 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.73 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  29.47 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  30.93 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  28.99 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.12 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.44 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.89 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.81 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.9 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.19 
 
 		 814 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.6 
 
 		 287 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 982 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  29.57 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.1 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.11 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.93 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  26.79 
 
 		 169 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.47 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.51 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  25.47 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  26.67 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  30.88 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  29.8 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  26.49 
 
 		 174 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.97 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  24.51 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.39 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.81 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  41.67 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.63 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.68 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  21.6 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  24.23 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.26 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  42.65 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.71 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  25 
 
 		 166 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  35.21 
 
 		 270 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.3 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  27.23 
 
 		 169 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.24 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.17 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.57 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.38 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.44 
 
 		 176 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.27 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.9 
 
 		 166 aa  48.5  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  36.62 
 
 		 270 aa  48.5  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  29.47 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  26.6 
 
 		 184 aa  48.5  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  26.6 
 
 		 184 aa  48.5  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  41.98 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.14 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.11 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.46 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  25.7 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  46.55 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  25.11 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  38.03 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  24 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  25.11 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  27.7 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.39 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  39.66 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1013  nitroreductase family protein  25 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  27 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  48.15 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  26.6 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  24.57 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.27 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.12 
 
 		 176 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>