More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3515 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  84.24 
 
 		 184 aa  332  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  71.89 
 
 		 186 aa  286  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  71.89 
 
 		 186 aa  285  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  71.66 
 
 		 188 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  47.28 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  46.74 
 
 		 194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  43.78 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  46.2 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  41.85 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  39.34 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  40.22 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  38.3 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.96 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  34.57 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  34.74 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.52 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.76 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  35.2 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.91 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  34.05 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  34.05 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.98 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.15 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.16 
 
 		 176 aa  101  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32.58 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.9 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  31.38 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  33.33 
 
 		 173 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.08 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.65 
 
 		 163 aa  97.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  34.73 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  30.93 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  32.45 
 
 		 173 aa  96.3  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.91 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.05 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.05 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  34.97 
 
 		 173 aa  94.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  33.88 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  31.91 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  31.22 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.69 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30.22 
 
 		 175 aa  90.9  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  33.7 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  32.63 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.5 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.46 
 
 		 278 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  33.53 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  32.6 
 
 		 167 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.69 
 
 		 173 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  31.22 
 
 		 274 aa  88.6  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.22 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  31.89 
 
 		 166 aa  88.2  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.95 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  33.33 
 
 		 170 aa  87.8  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.63 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  33.16 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.74 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  32.12 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.48 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.88 
 
 		 171 aa  85.9  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.7 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  29.67 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.98 
 
 		 584 aa  85.5  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.12 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30.73 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.43 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.37 
 
 		 209 aa  84.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.51 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  29.17 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  30.65 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  31.32 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.35 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.42 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.65 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  27.27 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  30.33 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  33.51 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  26.37 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.85 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.64 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.49 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.32 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  28.93 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.46 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  29.79 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.1 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.77 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  28.73 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.65 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  32.62 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.7 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  28.86 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  27.49 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  30.14 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.07 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.57 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.19 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.23 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>