More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1045 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  100 
 
 
174 aa  357  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  65.29 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  50.65 
 
 
192 aa  148  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  46.11 
 
 
170 aa  142  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  43.1 
 
 
174 aa  141  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  47.93 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  43.71 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  49.66 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  43.71 
 
 
176 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  39.89 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  38.46 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  41.62 
 
 
178 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  37.7 
 
 
186 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  45.33 
 
 
175 aa  121  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  39.88 
 
 
194 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  37.28 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  39.88 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  38.04 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  39.43 
 
 
176 aa  117  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  36.96 
 
 
186 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  39.01 
 
 
188 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  43.87 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  37.57 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  40.59 
 
 
178 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  37.43 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  38.76 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  39.16 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  36.84 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  36.72 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  36.79 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  38.18 
 
 
166 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  38.18 
 
 
166 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  38.46 
 
 
167 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  37.28 
 
 
167 aa  104  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  35.63 
 
 
329 aa  103  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  39.61 
 
 
176 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  31.25 
 
 
204 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  39.18 
 
 
172 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  33.71 
 
 
170 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  34.91 
 
 
176 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  35.06 
 
 
170 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.59 
 
 
278 aa  99  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  36.25 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  37.57 
 
 
235 aa  98.6  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  34.72 
 
 
214 aa  98.2  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  39.75 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  34.72 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  36.26 
 
 
190 aa  97.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  35.67 
 
 
179 aa  97.4  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  33.33 
 
 
169 aa  97.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  34.32 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  36.21 
 
 
181 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  36.21 
 
 
181 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.68 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  32.93 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  34.34 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  40 
 
 
166 aa  95.9  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  31.64 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  33.55 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  37.01 
 
 
169 aa  94.4  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  34.71 
 
 
176 aa  94  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  35.29 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  31.84 
 
 
261 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  31.58 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  34.52 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.52 
 
 
222 aa  92.8  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  32.64 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  39.2 
 
 
348 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  32.34 
 
 
215 aa  92.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  31.52 
 
 
201 aa  91.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  33.99 
 
 
197 aa  91.3  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.81 
 
 
227 aa  91.3  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  34.42 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  31 
 
 
213 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  35.71 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.35 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  30.99 
 
 
214 aa  89  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.82 
 
 
180 aa  89  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.54 
 
 
240 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  34.72 
 
 
274 aa  89  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  31.92 
 
 
215 aa  88.6  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  31.92 
 
 
215 aa  88.6  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  31.92 
 
 
215 aa  88.6  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  31.92 
 
 
215 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34 
 
 
584 aa  87.8  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  34.5 
 
 
171 aa  87.4  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  33.13 
 
 
171 aa  87.4  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  33.12 
 
 
171 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  33.01 
 
 
237 aa  87  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
982 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  34.88 
 
 
180 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  34.16 
 
 
176 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  36.42 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  33.76 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  26.02 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.95 
 
 
275 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  30.99 
 
 
215 aa  86.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  31.79 
 
 
350 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  34.38 
 
 
234 aa  85.9  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.05 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>