210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1547 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  76.23 
 
 
274 aa  354  5.999999999999999e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  76 
 
 
237 aa  346  1e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  64.38 
 
 
235 aa  305  3e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  55.02 
 
 
202 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  48.78 
 
 
221 aa  201  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  52.15 
 
 
239 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  47.12 
 
 
250 aa  181  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  50.97 
 
 
242 aa  181  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  45.77 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  47.78 
 
 
225 aa  171  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  40.29 
 
 
205 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  39.32 
 
 
205 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  39.18 
 
 
189 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  40.3 
 
 
207 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  40.67 
 
 
382 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  39.35 
 
 
251 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  37.2 
 
 
236 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  40.98 
 
 
244 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  39.3 
 
 
259 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  38.32 
 
 
248 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  40.48 
 
 
259 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  35.35 
 
 
246 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  38.27 
 
 
253 aa  115  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  38.38 
 
 
257 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  38.16 
 
 
249 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  38.25 
 
 
246 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  37.36 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  33.97 
 
 
252 aa  108  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  42.08 
 
 
242 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  33.48 
 
 
257 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  36.32 
 
 
354 aa  106  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  34.55 
 
 
252 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  34.69 
 
 
508 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  34.69 
 
 
508 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  36.98 
 
 
255 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  33.17 
 
 
253 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  32.2 
 
 
218 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  35.26 
 
 
214 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  33.65 
 
 
375 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  35.42 
 
 
254 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  35.24 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  33.49 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  34.39 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  35.03 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  32.02 
 
 
217 aa  95.5  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  34.5 
 
 
503 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  37.37 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  34.18 
 
 
510 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.05 
 
 
371 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  38.6 
 
 
203 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  37.23 
 
 
356 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  33.83 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  32.38 
 
 
247 aa  92  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  33.81 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  31.4 
 
 
222 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  28.64 
 
 
202 aa  88.6  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  30.77 
 
 
510 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
262 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  30.32 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  32.68 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.38 
 
 
174 aa  85.9  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  28.29 
 
 
193 aa  85.5  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  33.49 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  30.43 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  33.82 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  32.86 
 
 
282 aa  82  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  30.85 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  35.19 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  33.17 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  32.08 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  31.18 
 
 
518 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  32.08 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  32.32 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  31.84 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.2 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  35.58 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  31.1 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  29.69 
 
 
523 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  32.2 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  33.01 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  35.29 
 
 
530 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.15 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.31 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  31.84 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.99 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  34.54 
 
 
491 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  35.76 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  30.56 
 
 
475 aa  68.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  29.73 
 
 
474 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  35.94 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  27.8 
 
 
3002 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  32.84 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  25 
 
 
1514 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>